# Szablon pracy dyplomowej

Jak pobrać repozytorium i rozpocząć pisanie pracy magisterskiej w RStudio przy uzyciu formatu Markdown (Quarto)?

## 1. Pobranie repozytorium

### Opcja A: Pobieranie przez Git (zalecane)

Jeśli masz zainstalowany Git:

```bash
# przejdź do katalogu, w którym chcesz umieścić projekt w terminal/cmd
git clone http://150.254.88.90:3000/PKleka/Szablon-pracy-dylomowej.git
cd "Szablon pracy dyplomowej"
```

Kopia całego repozytorium zawiera wszystkie pliki i zacznij od usunięcia niepotrzebnych.

### Opcja B: Pobieranie jako ZIP

1. Kliknij niebieski przycisk **Code** na stronie repozytorium
2. Wybierz **Download ZIP** wybranego katalogu (do wyboru UAM / UZ)
3. Rozpakuj archiwum w wybranej lokalizacji na dysku
4. Przejdź do folderu z rozpakowanymi plikami

## 2. Instalacja oprogramowania

### 2.1. Instalacja R

1. Przejdź na stronę: https://cran.r-project.org/
2. Wybierz wersję dla swojego systemu operacyjnego:
   - **Windows**: kliknij "Download R for Windows" → "base" → pobierz instalator
   - **macOS**: kliknij "Download R for macOS" → wybierz odpowiednią wersję dla swojego procesora (Intel/Apple Silicon)
   - **Linux**: postępuj zgodnie z instrukcjami dla swojej dystrybucji
3. Uruchom pobrany instalator i postępuj zgodnie z instrukcjami
4. Zalecana wersja: R 4.3.0 lub nowsza

### 2.2. Instalacja RStudio

1. Przejdź na stronę: https://posit.co/download/rstudio-desktop/
2. Przewiń w dół do sekcji **"2: Install RStudio"**
3. Pobierz wersję RStudio Desktop dla swojego systemu operacyjnego
4. Uruchom instalator i postępuj zgodnie z instrukcjami

### 2.3. Sprawdzenie instalacji

1. Uruchom RStudio
2. W konsoli R (dolne lewe okno) wpisz:
   ```r
   version
   ```
3. Powinieneś zobaczyć informacje o zainstalowanej wersji R

## 3. Instalacja niezbędnych pakietów

Po uruchomieniu RStudio, musisz zainstalować pakiety potrzebne do pracy z tym szablonem.

### 3.1. Pakiety podstawowe

W konsoli R wykonaj następujące komendy (jedna po drugiej):

```r
# Instalacja menedżera pakietów (jeśli nie jest zainstalowany)
install.packages("pak")

# Instalacja pakietów do pracy z Quarto i RMarkdown
install.packages("quarto")
install.packages("rmarkdown")
install.packages("knitr")

# Pakiety do bibliografii i cytowań
install.packages("knitcitations")
install.packages("bibtex")
```

Więcej o języku R na stronie https://kleka.web.amu.edu.pl/nauka/wprowadzenie_do_R.html

### 3.2. TinyTeX - instalacja LaTeX-a

LaTeX jest niezbędny do generowania dokumentów PDF. Najłatwiejszym sposobem instalacji jest użycie pakietu `tinytex`:

```r
# Instalacja pakietu tinytex
install.packages("tinytex")

# Instalacja dystrybucji TinyTeX
tinytex::install_tinytex()
```

**Uwaga**: Instalacja TinyTeX może potrwać kilka minut. Po zakończeniu **uruchom ponownie RStudio**.

### 3.3. Weryfikacja instalacji TinyTeX

Po ponownym uruchomieniu RStudio sprawdź, czy TinyTeX został poprawnie zainstalowany:

```r
tinytex::is_tinytex()
```

Jeśli wynik to `TRUE`, instalacja przebiegła pomyślnie.

### 3.4. Dodatkowe pakiety LaTeX (w razie potrzeby)

Jeśli podczas kompilacji dokumentu pojawią się błędy związane z brakującymi pakietami LaTeX, możesz je doinstalować:

```r
# Instalacja konkretnego pakietu LaTeX
tinytex::tlmgr_install("nazwa_pakietu")

# Przykłady często potrzebnych pakietów:
tinytex::tlmgr_install("babel-polish")
tinytex::tlmgr_install("csquotes")
tinytex::tlmgr_install("caption")
tinytex::tlmgr_install("fancyhdr")
```

## 4. Rozpoczęcie pracy

1. Otwórz plik `dyplom.Rproj` - uruchomi on RStudio (podwójne kliknięcie)
2. Otwórz plik `_START.qmd` - to główny plik Twojej pracy
3. Edytuj zawartość zgodnie z wymaganiami pracy dyplomowej
4. Aby wygenerować PDF:
   - Kliknij przycisk **Render** (lub naciśnij `Ctrl+Shift+K` / `Cmd+Shift+K`)
   - Poczekaj na zakończenie kompilacji
   - Dokument PDF pojawi się w tym samym folderze

## 5. Struktura projektu

- `_START.qmd` - główny plik pracy dyplomowej
- `analiza.qmd` - przykładowy rozdział z analizą danych
- `poradnik.qmd` - poradnik formatowania i pisania pracy
- `literatura.bib` - baza danych bibliograficznych (format BibTeX)
- `dyplUAM.cls` - klasa LaTeX dla formatu pracy
- `header.tex` - dodatkowe ustawienia LaTeX
- `before-body.tex` - strona tytułowa i deklaracje

## 6. Rozwiązywanie problemów

### Problem: Błąd podczas generowania PDF

- Sprawdź, czy TinyTeX jest zainstalowany: `tinytex::is_tinytex()`
- Sprawdź komunikaty błędów - często wskazują na brakujące pakiety LaTeX
- Zainstaluj brakujące pakiety używając `tinytex::tlmgr_install()`

### Problem: Encoding/znaki polskie się nie wyświetlają

- Upewnij się, że plik jest zapisany w kodowaniu UTF-8
- W RStudio: Tools → Global Options → Code → Saving → Default text encoding: UTF-8

### Problem: Bibliografia się nie generuje

- Sprawdź, czy plik `literatura.bib` istnieje i jest poprawnie sformatowany
- Upewnij się, że w nagłówku YAML dokumentu jest podana ścieżka do pliku bibliografii

## Pomoc

W razie problemów skontaktuj się z promotorem